黃金博物園區裡，除了生活美學體驗館、煉金樓、環境館、太子賓館與本山五坑之外，就是以黃金為名的黃金館了。顧名思義，其內部展覽自然圍繞著黃金的主題。展覽以常設展的方式來呈現，位於黃金館一、二樓，可分為兩大主軸：
一樓以九份、金瓜石一帶的採礦歷史和相關礦業文物為展示主題，展示中最引人注目的，乃是新加入的展品九份金球，它可謂代表了從前九份地區私人煉金的具體成果。
二樓則是彷彿攤開了一張黃金藏寶圖般，由歷史、文化、藝術、科學等多元面向來探討黃金的無限可能。